Electroforesis de proteínas y Western blot DENV

Delia Piedad Recalde-Reyes, Juliana Lopez Calderon

Published: 2023-06-27 DOI: 10.17504/protocols.io.kxygx963dg8j/v1

Abstract

Una prueba tipo Western Blot (también conocida como inmunotransferencia) es una técnica utilizada para detectar proteínas específicas en una muestra. El procedimiento consiste en separar las proteínas de la muestra en función de su tamaño mediante la técnica de electroforesis para luego ser transferida a una membrana de polivinilo.

La membrana se somete a una serie de pasos de bloqueo y lavado para eliminar las proteínas no específicas y prevenir la unión no específica de anticuerpos en la muestra. Se añade un primer anticuerpo específico que se unen a la proteína de interés y un anticuerpo secundario que se une al anticuerpo primario.

Finalmente, se utiliza un sustrato químico que reacciona con el anticuerpo secundario para producir una señal visual que indica la presencia de la proteína de interés. La intensidad de la señal visual está relacionada con la cantidad de proteína presente en la muestra.

Este protocolo fue desarrollado gracias al apoyo administrativo de la CUE Alexander von Humboldt de Armenia y desarrollado dentro de la convocatoria de Minciencia 917 de estancia en investigación: Desarrollo de una prueba tipo Western blot, Dot blot e Inmunofluorescencia para detección de antígenos virales de dengue serotipos 1 – 4.

Before start

Preparar todos los medios y reactivos necesarios para usar en el inmunoensayo. Asegúrese de contar con la candad suficientes para cada uno de los pasos.

Steps

1.

Gel de electroforesis de proteínas (Denaturante) al 10% (Volumenes suficientes para 2 geles)

Preparar gel de resolución empleando

Acrilamida bis acrilamida 40% 2.5mL

1.5M Tris HCl pH 8.8 2.5mL

SDS 10% 100µL

Agua destilada 4.845mL

TEMED 5µL

PSA 10% 50µL

VOLUMEN TOTAL 10mL

Después de adicionar los reactivos en la cámara de proteínas puede adicionarse 300µL de metanol absoluto para favorecer la polimerización del gel.

Note
- El persulfato de amonio (PSA) debe diluirse en agua destilada y preparar fresco siempre antes de usar. No se recomienda emplear persulfato refrigerado o congelado.- Adicionar los reactivos en el orden que se muestran, se recomienda adicionar el TEMED Y PSA al 10% al finalizar la mezcla.- Evitar la formación de burbujas de aire. La reacción se da en ausencia de oxígeno.

Gel de empaquetamiento (staking) al 4% (Volumenes suficientes para 2 geles)

Acrilamida bis acrilamida 40% 0.5mL

1.5M Tris HCl pH 6.8 1.25mL

SDS 10% 50µL

Agua destilada 3.160mL

TEMED 5µL

PSA 10% 25µL

VOLUMEN TOTAL 5mL

Note
Geles de resolución de acuerdo con el peso de las proteínas Porcentaje Acrilamida Rango de separación KDa5 60 - 210 7.5 35 - 9510 15 - 7015 4 - 200

Correr el gel a 80 voltios( 8 voltios por cada cm de gel ) hasta que termine la corrida en el gel de empaquetamiento.

Posteriormente correr entre 12 a 15 voltios por cm de gel (entre 120 a 150 voltios) durante 60 minutos.

Si esta corriendo un gel a 30mAmp y para 2 geles 60mAmp.

2.

Preparación de la muestra

Preparación buffer carga 2X

SDS al 10% 6mL

Glicerol al 50% 15mL

Azul de bromofenol al 1% 0.3mL

0.5 M Tris HCl pH 6.8 3.75mL

Agua destilada ajustar a 30mL

Adicionar B mercaptoetanol a 950µL de muestra antes de usar.

Protocolo tomado y adaptado de BioRad.

Adicion buffer carga a la muestra

Para 10µLde muestra añadir:

5µL de muestra (entre 5µg a 10µg de proteína total para un minigel o determinar concentración de proteínas por BCA.

4.75µL de buffer carga

0.25µL de betamercaptoetanol

Total muestra 10µL

Calentar muestra 90°C-100°C durante 0h 5m 0s ó a 70°C durante 0h 10m 0s

Cargar muestra a cada pozo 10µL

Note
Se puede cargar entre 40 40µg a 60µg de muestras con proteína total no pura (antígeno total) y entre 0.5µg a 4µg de proteínas puras. En caso de necesitar diluir las muestras de proteína total puede hacerse empleando PBS 1X.

3.

Transferencia semi seca de proteínas

Buffer de transferencia 1L

3.029gde Tris Base

14.263gde glicina

Diluir empleando agua destilada, ajustar volumen hasta 700mL

Verificar pH a 8.3 o ajustar hasta alcanzar un volumen de 800mL

Llevar a 1000mLempleando 200mL de metanol absoluto.

Para realizar la transferencia del gel de proteinas a la membrana se debe hidratar previamente la membrana sumergiendola durante 0h 5m 0s en metanol absoluto, posterior a esto poner en contacto la membrana de polivinilo con el gel de electroforesis.

Eliminar las burbujas restantes entre gel membrana

Tanto gel como membrana deben ponerse sobre papel filtro BioRad Cat. 1703960

El papel filtro debe sumergirse previamente en buffer de transferencia a 4°Cdurante 0h 5m 0s

El orden de los elementos debe ser el siguiente desde la parte superior hasta la inferior

Papel filtro

Gel

Membrana de polivinilo 0.45um

Papel filtro

La trasferencia se realiza en equipo trans tubo blot de BioRad empleando el protocolo éstandar preestablecido para 2 mini geles

25 voltios - 1.0A - 0h 30m 0s

Note
Para verificar la transferencia del gel a la membrana, puede realizarse coloración de la misma empleando rojo Ponceau. La coloración de rojo de ponceau se prepara empleando 0.25g de rojo de ponceau, 15 mL de acido acético llevar a 60mL de volumen disuelto en agua destilada, emplear 40mL de metanol (0,25% P/V rojo Ponceau en 15% V/V ácido acético y 40% V/V metanol)Esta coloración es rápida, no es permanente, no afecta ensayos posteriores y se elimina fácilmente lavando la membrana al emplear agua destilada.

4.

Bloqueo membrana de PVDF

Cada membrana sensibilizada fue bloqueada empleando leche descremada al 5%, disuelta en TBS-T.

Note
La membrana debe quedar sumergida en su totalidad en solución de bloqueo, el lado liso debe ir hacia abajo preferiblemente.

5.

Adición anticuerpo primario

Se emplearon sueros de origen humano previamente determinados por kit comerciales como

Positivos para DENV y Negativos para DENV.

Estos anticuerpos fueron diluidos 1:200 empleando solución de bloqueo.

La reacción fue incubada durante 2h 0m 0s a temperatura ambiente 20°C en agitación constante 120rpm.

6.

Lavados

Se realiza lavado de la membrana con 5mL de TBS- Tween- 0,05% (TBS-T) por 0h 5m 0s, este proceso se repite tres veces.

7.

Anticuerpo secundario

El anticuerpo secundario (Anti human Sigma Cat. A8542) fue diluido 1:5000 en TBS-T con azida de sodio (NaN3) al 0,03%.

Note
El anticuerpo secundario debe ser desechado posterior a su utilización.Para asegurarse de la eliminación de residuos de leche descremada la membrana puede lavarse empleando agua destilada.

8.

Lavados

Se realiza lavado de la membrana con 5mL de TBS- Tween- 0,05% (TBS-T) por 0h 5m 0s, este proceso se repite tres veces.

9.

Para revelar la reacción se empleó sustrato (BCIP/NBT) Thermo Scientific Ref: 34042, la reacción se incubó a 37°C durante 0h 5m 0s.

La reacción se detuvo empleando agua destilada.

Las membranas se secaron a temperatura ambiente por 0h 5m 0s.

10.

Lectura de los resultados

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