基因

2014年华大发表的弹涂鱼文章中基因预测部分内容如下:编码基因采用以下三种方式预测: (1) **基于同源预测**:利用同源物种的蛋白网基因组上比对(利用tblastn 参数为-5.),然后将比对上的区域连接起来并扩充 (2)**利用屏蔽掉重复序列之后的基因组做从头预测**:从同源基因集中随机挑选1500个完成基因来对augustus进行训练。利用Augustus和genscan两个软件进行从头预