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详细分析基因组完整性评估
前段时间介绍了一款软件BUSCO,更久之间也介绍过CEGMA。今天我从个人的经验上阐述下关于基因组完成性的一些想法,希望大家能有所收获。1、基因组完整性首先是什么是基因组完整性,为啥要评估它。大家都清
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风险模型都是权重X表达,OUT了
最近有很多跟我们合作分析的客户,跟我们沟通,说你们做的好多模型,怎么都不能利用拟合公式表达出来,这位同学,你得给我站起来听课了,谁说的模型就一定得用公式表达出来啊,不能利用公式表达的多了去了。今天小编
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最大简约法构建进化树详解
小故事据说在亚细亚的一座古城里,有一辆古代皇帝遗留的战车,车辕上有一个十分复杂的结子,谁能解开它谁就能征服亚细亚。一时间,很多企图得到亚细亚的人都试图来解开它,但很多天过去了,没有人成功。有一天,马其
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CrIMMix R package--无监督聚类方法汇总
无监督聚类方法多种多样,分析时不知从何入手?今天小编给大家带来一个无监督聚类分析方法对比的文章,其中包含了13种无监督聚类的方法及相关的R包,并且将其汇总构建R包CrIMMix。Clustering
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你用的癌症细胞系是否有问题?CCLA帮你鉴定
你是否遇到过癌症细胞系污染或者误用的情况呢?今天介绍一款简单易用的,基于基因表达数据的癌症细胞系鉴定工具CCLA ( Briefings in Bioinformatics 2020)。背景介绍癌症细
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KEGG数据库的自动注释服务
KEGG AutomaticAnnotationServer,KEGG数据库的自动注释服务简称KAAS。在线网址为http://www.genome.jp/tools/kaas/。在我们处理无参转录组
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新冠下的反思:对于病原感染,是否应该防患于未然
新冠疫情下的反思:对于病原感染,是否应该防患于未然2019新型冠状病毒给我们带来了什么?新冠疫情在全球扩散蔓延的形势令人担忧,带来了巨大的损失和挑战。经历了这一次大规模的感染后,我们需要反思。病毒是全
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缺血性心肌病ceRNA
今天跟大家分享的是一月份发表在bioscience reports.(IF: 2.535) 杂志的一篇文章,这是一篇关于ceRNA三元组与缺血性心肌病的研究。A susceptibility biom
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【高分文章秘籍】大样本(全)转录组剑指高分文章
在九月的桂花香中,又迎来了一个新的开学季。秋高气爽的空气中,校园里洋溢着朝气蓬勃的笑脸。在新的学年,您又有哪些新的学习计划,研究领域又有哪些热门研究和前沿趋势? 首先,我们来调研一下目前转录调控高分文