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DNA 甲基化数据分析流程（bismark + methylKit）DNA甲基化在维持细胞正常功能、传递基因组印记，胚胎发育、肿瘤发生等方面发挥重要作用，目前已经成为表观遗传学和表观基因组学的研究热点。针对不同的研究目的，基于高通量测序的甲基化研究方法也是日新月异，色彩缤纷，本文简单总结一下比较常规的全基因组DNA甲基化测序数据的分析流程。基本流程分为两个步骤，mapping（bismark软件）

DNA 甲基化数据分析流程

行业观点 • 2025-02-09 10:24:44

DNA 甲基化数据分析流程（bismark + methylKit）DNA甲基化在维持细胞正常功能、传递基因组印记，胚胎发育、肿瘤发生等方面发挥重要作用，目前已经成为表观遗传学和表观基因组学的研究热点

DNA 数据分析肿瘤数据处理基因组学
MiTranscriptome—通过计算学重构人类转录过程的蓝图

行业观点 • 2025-02-09 10:10:44

一、导语MiTranscriptome是由密歇根大学的临床病理中心卫生系统（Michigan Center for Translational Pathology at the University

DNA 肿瘤 lncRNA 基因 RNA
一文知晓线粒体质量控制如何生信

行业观点 • 2025-02-08 14:27:44

你可以永远相信线粒体热点不一样的线粒体思路：线粒体动力学国自然中标热点预测：线粒体动力学马上就到国自然申报时间了，小伙伴们手里是否已经有准备好合适的课题打赢这场战争？回顾22年国自然中标情况，线粒体第

免疫肿瘤 lncRNA 基因 RNA
非肿瘤疾病也可以构建预测模型啦

行业观点 • 2025-02-08 14:14:44

非肿瘤疾病也可以构建预测模型啦阿尔茨海默病（AD）作为一种慢性进行性神经退行性疾病，是由淀粉样蛋白-β斑块和神经纤维缠结定义的。散发性AD（即典型的AD痴呆）最常见的临床表现是一种缓慢进行的遗忘性疾病

免疫肿瘤网络
性价比超高的机器学习新思路也不是天天有，抓紧！

行业观点 • 2025-02-08 13:34:44

机器学习方法是每一个生物信息从业人员都绕不开的能力要求，可以说生物信息领域研究，对生物医学数据的挖掘和解析大都得益于有效的机器学习算法的选择和应用。随着近年来计算机算力的提升和硬件发展，机器学习的重要

免疫肿瘤分类网络基因
文献解读：生信分析结合湿实验验证研究子宫内膜癌预后相关基因

行业观点 • 2025-02-08 12:27:44

大家好呀！今天跟大家分享的是2021年5月发表在 Cancer Cell International IF:4.175）上的一篇文章，主要是基于TCGA数据集和MsigDB数据库使用随机森林，LASS

B细胞免疫肿瘤免疫治疗
NBT-空间转录组的超高分辨聚类方法BayesSpace

行业观点 • 2025-02-08 11:05:44

空间转录组能够在保留空间信息的前提下，检测基因表达量。然而当前的计算方法，并不能利用空间转录组提供的位置信息。同时受限于测序技术的检测分辨率，无法做到单细胞的分辨率。6月3日“自然生物技术”的论文S

差异基因免疫肿瘤预测基因回归
我们到9分SCI需要跨越几个银河系？

行业观点 • 2025-02-08 10:52:44

小编最近看了一篇发表在THORAX上的文章，题目为“Gene correlationnetwork analysis to identify regulatoryfactors in idiopath

肿瘤网络 miRNA 基因 RNA
非肿瘤疾病公共数据轻松7+技巧

行业观点 • 2025-02-08 09:30:44

基于公共数据的非肿瘤疾病研究，由于数据受限等种种原因，想发7+的文章相对来说还是比较困难的。肿瘤研究至少有TCGA等数据库支撑，就算想发10+也是有可能的。今天跟大家分享一篇非肿瘤领域的纯生信文章，一

免疫数据分析差异基因肿瘤发病机制生物信息学网络
DNA甲基化数据+转移性黑色素瘤患者分层

行业观点 • 2025-02-07 15:26:44

大家好呀！今天跟大家分享一篇2021年6月发表在Journal for ImmunoTherapy of Cancer（IF:13.751）上的文章。研究流程：一、摘要背景：近年

DNA 免疫 B细胞肿瘤免疫治疗 T细胞分类

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