行业观点
-
TCGA临床病理随访资料解读
很多人问怎么计算病人的生存时间,怎么获取病人的治疗方案,怎么知道病人肿瘤转移位置等等,每个人研究关注点不同,但是TCGA提供了非常详细的病理资料以供不同的研究人员研究,今天就用胃癌作为例子简单讲解一下
-
-
Circos中的三种数据格式文件介绍
Circos整体学习(2) Circos中的三种数据格式文件介绍Circos主要是展示关系的,因此小编简单的介绍下circos中关于关系部分是如何展示的,其实这些关系首先你已经利用各种手段获取
-
DiseaseMeth2:人类疾病甲基化数据库介绍
今天小编给大家安利一个发表在《Nucleic Acids Research》上的人类疾病甲基化数据库哈,该数据库已经更新到第二个版本啦,对于大多数发完文章就停止维护的数据库来说,这是非常有态度的一个数
-
-
TCGA数据分析利器又更新啦—GEPIA 2021!
今天小编要和大家分享的是GEPIA 2021,大家可能都知道GEPIA是利用TCGA数据做可视化分析中比较著名的一款在线工具,该网站由北大张泽民教授团队开发,2017年发表在Nucleic Acids
-
CDS和ORF的区别
ORF和CDS的区别ORF的英文展开是open reading frame(开放阅读框)。CDS的英文展开是coding sequences (编码区)。CDS:DNA转录成mRNA,mRNA经剪接等
-
如何评估应该测多少数据量
考虑这样一个问题,“如果要保证基因组上95%的区域其覆盖深度在30x以上的话,那么最低的平均测序深度应该是多少?”。 关于测序量的估计,对于做生物信息的人来讲应算是家常便饭了,多数时候我们都能直接根
-
-