Illumina作为测序行业的龙头企业，所占市场份额达70%（15年）。最初由四位博士于1998年共同创建，总部位于美国加利福尼亚圣地亚哥,主要销售微阵列芯片，于2000年在纳斯达克挂牌上市。2006年收购Solexa公司，获得新一代高通量测序技术，从而成为目前市场上的主流测序技术公司。

Illumina 旗下测序仪器

GA系列：Genome Analyzer, Genome analyzer IIx

HiSeq 系列: HiSeq 2000, HiSeq 2500, HiSeq3000, HiSeq 4000

Miseq系列

HiSeq X系列: HiSeq X Five, HiSeq X Ten

NextSeq系列：NextSeq 500, NextSeq 550

Illumina测序原理

Illumina测序采用边合成边测序技术(Sequencingby sythesis,SBS), 步骤如下:

Illumina测序采用边合成边测序技术(Sequencing by sythesis,SBS).步骤如下:

步骤一.建库，在DNA片段两端加上序列已知的通用接头构建文库，文库加载到测序芯片Flowcell

步骤二. 簇生成。文库两端的已知序列与Flowcell基底上的Oligo序列互补，每条文库片段都经过桥式PCR扩增形成一个簇

步骤三. 簇扩增及测序。与步骤二同时进行。即在碱基延伸过程中，每个循环反应只能延伸一个正确互补的碱基，根据四种不同的荧光信号确认碱基种类，保证最终的核酸序列质量，经过多个循环后，完整读取核酸序列。

什么是Flowcell?什么是Lane?

(图片摘自千年基因)

上图展示的是FlowCell， 以HiSeq2000为例:

每个flowcell有8个泳道，一个泳道称为一个Lane，每条Lane上有两列，每列有多个有小格子，叫一个tile。

测序仪器不同，可以放置的FlowCell个数和Lane的条数也有所区别。

下面一张图展示建库以及簇生成。

Illumina仪器系列介绍

1) Genome Analyzer,GA最初是Solexa公司自己推出的NGS系统。2006年Illumina公司收购了Solexa，在不断测序和改良后，推出了GA IIx和HiSeq2000平台。目前GA系列已不再出售。

2) HiSeq 系列。HiSeq2000发布后，2010年华大基因利用国开行给的贷款购买了128台HiSeq测序仪，这笔订单是Illumina迄今为止最大的一笔订单。后续通量不断扩大升级, 价格/G不断降低. HiSeq X Ten又是2014年推出的一个更大升级，将10台HiSeq X连接起来，当然仪器价格会高，但如果达到通量，单G数据成本也会大大降低。由于HiSeq X Ten价格太高，通量太大，2015年又推出了HiSeq X five， HiSeq X Ten的缩小版，由五台HiSeq X组成，同时推出的还有HiSeq 3000/4000和NextSeq 550.

其中Hiseq X Five和HiSeq X Ten显示为单台Hiseq X的性能。

3) MiSeq

测序时间快，可以用小基因组或者外显子的测序。测序成本相对HiSeq要高

4) NextSeq

NextSeq 500 于2014年初登陆市场，测序通量介于MiSeq与HiSeq之间，是目前最为灵活的测序平台，可以进行高中低通量的需求，例如外显子、转录组、人的全基因组测序等。2015年，新推出了NextSeq 550系统,整合了高通量测序和芯片扫描功能,测序模块与NextSeq 500完全相同,适用于细胞遗传学和生殖健康。

参考整理来自Illumina官方网站和网络资源

原文地址：http://blog.sina.com.cn/s/blog_5c2f929b0102w5b8.html

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